Protein–RNA interactions for Protein: Q9NY84

VNN3, Vascular non-inflammatory molecule 3, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VNN3Q9NY84 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 FDXR-204ENST00000442102 1967 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VNN3Q9NY84 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VNN3Q9NY84 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.7 ms