Protein–RNA interactions for Protein: Q9NVM6

DNAJC17, DnaJ homolog subfamily C member 17, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 304 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJC17Q9NVM6 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 NRXN2-201ENST00000265459 6621 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 MAPT-203ENST00000340799 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 CCDC91-207ENST00000539107 2440 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 NEUROG1-201ENST00000314744 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 LAYN-203ENST00000436913 2590 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 AC034102.6-201ENST00000550947 559 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
DNAJC17Q9NVM6 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
DNAJC17Q9NVM6 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms