Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI5

PDS5B, Sister chromatid cohesion protein PDS5 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDS5BQ9NTI5 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC35.04■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC35.04■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC35.03■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 KRT18-202ENST00000388837 1420 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 CNRIP1-201ENST00000263655 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC35.01■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC35.01■■■■□ 3.2
PDS5BQ9NTI5 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.01■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC35■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC35■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC35■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC34.99■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC34.98■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 ISCA1-202ENST00000326094 1264 ntTSL 3 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.97■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC34.96■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
PDS5BQ9NTI5 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
PDS5BQ9NTI5 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC34.95■■■■□ 3.18
PDS5BQ9NTI5 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.95■■■■□ 3.18
PDS5BQ9NTI5 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.18
PDS5BQ9NTI5 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PDS5BQ9NTI5 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PDS5BQ9NTI5 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
PDS5BQ9NTI5 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
PDS5BQ9NTI5 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PDS5BQ9NTI5 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PDS5BQ9NTI5 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PDS5BQ9NTI5 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
PDS5BQ9NTI5 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC34.93■■■■□ 3.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.6 ms