Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTI2

ATP8A2, Phospholipid-transporting ATPase IB, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP8A2Q9NTI2 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 B4GALT2-204ENST00000434555 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 AC010173.1-201ENST00000549023 1453 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
ATP8A2Q9NTI2 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A2Q9NTI2 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A2Q9NTI2 SMPDL3A-203ENST00000539041 1755 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A2Q9NTI2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A2Q9NTI2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A2Q9NTI2 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A2Q9NTI2 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A2Q9NTI2 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ATP8A2Q9NTI2 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8A2Q9NTI2 CREB3-201ENST00000353704 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8A2Q9NTI2 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8A2Q9NTI2 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8A2Q9NTI2 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8A2Q9NTI2 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ATP8A2Q9NTI2 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms