Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQW1

SEC31B, Protein transport protein Sec31B, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC31BQ9NQW1 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 HAGHL-213ENST00000564545 663 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SEC31BQ9NQW1 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 C5orf56-203ENST00000378953 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SEC31BQ9NQW1 FADS6-203ENST00000612771 2154 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms