Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ33

ASCL3, Achaete-scute homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ASCL3Q9NQ33 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ASCL3Q9NQ33 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
ASCL3Q9NQ33 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms