Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PDCL3Q9H2J4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PDCL3Q9H2J4 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms