Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
HOXD1Q9GZZ0 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 TNFAIP2-209ENST00000560869 4683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 HCK-203ENST00000375862 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 C5AR2-202ENST00000600626 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 MTMR12-203ENST00000382142 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 AC231657.2-201ENST00000624556 255 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 PAQR6-215ENST00000623241 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 AC254629.1-202ENST00000618276 2112 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
HOXD1Q9GZZ0 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
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