Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 PGPEP1L-202ENST00000535714 1483 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDGFDQ9GZP0 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 SLC25A22-216ENST00000531214 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 SUV39H2-202ENST00000354919 1233 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 BCAT2-207ENST00000597011 1579 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 TSSK6-201ENST00000585580 1467 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDGFDQ9GZP0 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.8 ms