Protein–RNA interactions for Protein: Q9C099

LRRCC1, Leucine-rich repeat and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRCC1Q9C099 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
LRRCC1Q9C099 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 PRTN3-201ENST00000234347 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 MIPEPP3-201ENST00000412105 444 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 PKMYT1-201ENST00000262300 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRRCC1Q9C099 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms