Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TINAGL1-211ENST00000537531 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 NAA38-201ENST00000333775 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 SHANK1-203ENST00000391813 4785 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 LENG9-203ENST00000611161 1916 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 CYGB-201ENST00000293230 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MAN1B1-AS1-201ENST00000596585 1872 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 AC024257.2-201ENST00000549699 147 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
GABARAPL3Q9BY60 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 SMURF1-202ENST00000361368 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 SAXO1-202ENST00000380534 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 DYNLT3-201ENST00000378578 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
GABARAPL3Q9BY60 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms