Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 ST3GAL5-202ENST00000377332 2165 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC14.62□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 AMIGO2-202ENST00000429635 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SNHG12Q9BXW3 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms