Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU20

RSG1, REM2- and Rab-like small GTPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 258 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSG1Q9BU20 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
RSG1Q9BU20 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 C19orf60-201ENST00000358607 839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 C19orf60-202ENST00000450195 702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ZNF419-210ENST00000520540 568 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CYHR1-201ENST00000306145 1409 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SMUG1P1-201ENST00000590640 811 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
RSG1Q9BU20 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms