Protein–RNA interactions for Protein: Q99999

GAL3ST1, Galactosylceramide sulfotransferase, humanhuman

Predictions only

Length 423 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAL3ST1Q99999 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 USP21-203ENST00000368002 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 CALY-201ENST00000252939 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 CRTC1-203ENST00000594658 2384 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 PTRH1-201ENST00000335223 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 C12orf43-208ENST00000539736 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 PBX1-222ENST00000627490 1769 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 AL445183.2-201ENST00000439621 1871 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 MZF1-203ENST00000594234 2385 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GAL3ST1Q99999 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms