Protein–RNA interactions for Protein: Q99460

PSMD1, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD1Q99460 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AP000525.1-201ENST00000608286 694 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
PSMD1Q99460 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 PRDX5-201ENST00000265462 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PSMD1Q99460 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms