Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q42

ALS2, Alsin, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2Q96Q42 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 CELF2-211ENST00000632065 1952 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 KRT8P36-201ENST00000489121 1440 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
ALS2Q96Q42 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 LRRC25-202ENST00000595840 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 SPN-202ENST00000395389 1935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 SOCS2-210ENST00000551556 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC27.36■■□□□ 1.97
ALS2Q96Q42 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.2 ms