Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q05

TRAPPC9, Trafficking protein particle complex subunit 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC9Q96Q05 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 EIF5A-205ENST00000419711 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AC068338.2-201ENST00000563278 1430 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 DHRS4-207ENST00000559632 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 PLLP-204ENST00000569059 665 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 PET100-202ENST00000594797 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRAPPC9Q96Q05 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 ARL5A-202ENST00000428992 747 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRAPPC9Q96Q05 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms