Protein–RNA interactions for Protein: Q96PP9

GBP4, Guanylate-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP4Q96PP9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 OGG1-217ENST00000449570 1948 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 GAS8-202ENST00000536122 1687 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
GBP4Q96PP9 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 ST7-OT4-201ENST00000397750 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 DHRS7-201ENST00000216500 2322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 AC012313.1-203ENST00000597980 570 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
GBP4Q96PP9 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms