Protein–RNA interactions for Protein: Q96JB3

HIC2, Hypermethylated in cancer 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIC2Q96JB3 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 AP001972.3-201ENST00000530792 495 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 FAM20B-201ENST00000263733 5984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 MRPL40-201ENST00000333130 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 TPSAB1-201ENST00000338844 1175 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 ALKBH6-212ENST00000485128 959 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 AC005229.4-201ENST00000610085 2198 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 EPHX3-204ENST00000602233 1805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
HIC2Q96JB3 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 AL645608.1-202ENST00000417705 1389 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 NAE1-203ENST00000379463 1909 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CDK6-202ENST00000424848 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
HIC2Q96JB3 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms