Protein–RNA interactions for Protein: Q96I99

SUCLG2, Succinate--CoA ligase [GDP-forming] subunit beta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUCLG2Q96I99 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 FASTK-201ENST00000297532 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 IRF3-221ENST00000598808 1468 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SUCLG2Q96I99 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 COX4I1-202ENST00000561569 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 LCE2A-201ENST00000368779 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 NFS1-214ENST00000541387 1436 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 PTDSS2-201ENST00000308020 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 GCHFR-201ENST00000260447 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 SUPT4H1-202ENST00000577396 1643 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 UBE2J2-201ENST00000347370 2387 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SUCLG2Q96I99 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms