Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 CHRDL2-203ENST00000376332 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ATG4CQ96DT6 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 DTX3-208ENST00000551632 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 AC121338.2-201ENST00000622535 1744 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 MAEA-213ENST00000510794 1607 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
ATG4CQ96DT6 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms