Protein–RNA interactions for Protein: Q96CX2

KCTD12, BTB/POZ domain-containing protein KCTD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD12Q96CX2 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 TMEM204-201ENST00000253934 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 MTND4LP12-201ENST00000448237 295 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 AC109587.1-201ENST00000482368 962 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 PABPN1-207ENST00000556821 1220 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 SLC27A3-204ENST00000368661 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 EDN3-204ENST00000371028 2397 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 KRT16P3-203ENST00000580621 1939 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
KCTD12Q96CX2 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms