Protein–RNA interactions for Protein: Q93084

ATP2A3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2A3Q93084 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 CNIH4-203ENST00000366858 702 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 ASGR1-204ENST00000572879 797 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 AL161908.1-201ENST00000451449 449 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 GOLGA4-212ENST00000617480 1545 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 TMEM161A-202ENST00000450333 1930 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ATP2A3Q93084 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 CYP21A1P-202ENST00000354927 1481 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 RGCC-201ENST00000379359 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 THOC3-201ENST00000265097 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ATP2A3Q93084 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms