Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 MYC-208ENST00000641036 567 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
PRG4Q92954 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC32.51■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 P2RY2-203ENST00000393597 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.5■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
PRG4Q92954 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms