Protein–RNA interactions for Protein: Q92752

TNR, Tenascin-R, humanhuman

Predictions only

Length 1,358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNRQ92752 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TNRQ92752 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNRQ92752 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNRQ92752 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNRQ92752 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNRQ92752 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC29.4■■■□□ 2.3
TNRQ92752 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
TNRQ92752 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNRQ92752 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNRQ92752 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNRQ92752 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNRQ92752 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNRQ92752 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNRQ92752 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNRQ92752 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
TNRQ92752 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNRQ92752 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNRQ92752 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNRQ92752 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNRQ92752 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNRQ92752 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNRQ92752 KDM2B-217ENST00000543852 1188 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNRQ92752 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNRQ92752 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNRQ92752 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.29
TNRQ92752 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNRQ92752 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNRQ92752 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNRQ92752 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNRQ92752 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNRQ92752 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNRQ92752 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNRQ92752 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNRQ92752 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
TNRQ92752 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNRQ92752 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNRQ92752 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNRQ92752 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNRQ92752 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNRQ92752 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNRQ92752 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNRQ92752 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNRQ92752 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNRQ92752 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNRQ92752 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
TNRQ92752 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
TNRQ92752 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNRQ92752 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNRQ92752 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNRQ92752 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNRQ92752 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC29.35■■■□□ 2.29
TNRQ92752 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC29.35■■■□□ 2.29
TNRQ92752 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 CCT7-202ENST00000398422 1234 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC29.34■■■□□ 2.29
TNRQ92752 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNRQ92752 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNRQ92752 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNRQ92752 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNRQ92752 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNRQ92752 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNRQ92752 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNRQ92752 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNRQ92752 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
TNRQ92752 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms