Protein–RNA interactions for Protein: Q8WYN3

CSRNP3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRNP3Q8WYN3 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 DDR1-228ENST00000376575 732 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 BCL2L10-202ENST00000561198 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 CPNE9-205ENST00000613455 1742 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.27■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.92
CSRNP3Q8WYN3 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC33.26■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.26■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 ZNF582-202ENST00000586929 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 CRHR1-214ENST00000619154 2370 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 LYSMD2-201ENST00000267838 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 NRN1-203ENST00000616243 1556 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 TNFRSF25-203ENST00000351959 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 CCDC107-202ENST00000378406 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 HAUS4-202ENST00000342454 1474 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 TMEM191B-203ENST00000613597 366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
CSRNP3Q8WYN3 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.18■■■□□ 2.9
CSRNP3Q8WYN3 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms