Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBN3

TMEM87A, Transmembrane protein 87A, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM87AQ8NBN3 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 EXD3-208ENST00000479452 962 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 ENPP7-201ENST00000328313 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 SNAP91-211ENST00000520213 2168 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 GABARAPL2-205ENST00000568455 646 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 P2RX2-201ENST00000343948 1494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 TMEM51-201ENST00000376008 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 AL158211.5-201ENST00000623583 2518 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 CYP2A6-201ENST00000301141 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 DOK7-206ENST00000515886 2263 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMEM87AQ8NBN3 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 CXCR3-202ENST00000373693 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 B3GALNT1-212ENST00000488170 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMEM87AQ8NBN3 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.5 ms