Protein–RNA interactions for Protein: Q8NB14

USP38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP38Q8NB14 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 SETD6-202ENST00000310682 2042 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 CDC123-201ENST00000281141 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 MAST1-208ENST00000591495 1496 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 ST3GAL3-207ENST00000353126 1969 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PSIP1-201ENST00000380715 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 AC113189.1-201ENST00000570444 327 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 AC020913.2-201ENST00000601929 629 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 C7orf49-213ENST00000617987 1727 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 SSTR3-202ENST00000617123 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 LEF1-203ENST00000438313 1488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 CXorf40A-204ENST00000423421 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 AC233263.1-201ENST00000578059 224 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 CDKN2C-203ENST00000396148 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 CBLC-201ENST00000270279 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
USP38Q8NB14 KRT17P3-201ENST00000420566 1262 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms