Protein–RNA interactions for Protein: Q8N9I9

DTX3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase DTX3, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DTX3Q8N9I9 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 AL031432.3-201ENST00000607698 485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 GLIS1-201ENST00000312233 2812 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 PRMT2-210ENST00000458387 1874 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
DTX3Q8N9I9 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 TRIM4-202ENST00000354241 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 TLE3-201ENST00000317509 5207 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AP006621.1-201ENST00000532946 536 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 BZW1-202ENST00000409226 2455 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 LTBP3-202ENST00000322147 4046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 NSUN5-204ENST00000438747 1663 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
DTX3Q8N9I9 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.1 ms