Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVU3

HERC6, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC6, humanhuman

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC6Q8IVU3 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 NEURL3-202ENST00000435380 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 AL590094.1-202ENST00000634619 1131 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 PTPRJ-201ENST00000418331 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 SNAPIN-201ENST00000368685 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 CCNG2-204ENST00000502280 1459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 Six3os1_6.1-201ENST00000620790 196 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 PPT2-248ENST00000395523 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 CERKL-201ENST00000339098 1677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 PDLIM2-216ENST00000464275 1995 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 P4HB-223ENST00000576390 439 ntTSL 4 BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
HERC6Q8IVU3 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms