Protein–RNA interactions for Protein: Q76B58

BRINP3, BMP/retinoic acid-inducible neural-specific protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRINP3Q76B58 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 ATP5G1P1-201ENST00000448724 379 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 AC097662.2-201ENST00000641359 267 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 MAZ-214ENST00000568544 1464 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
BRINP3Q76B58 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 ACAA1-202ENST00000333167 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 SDHA-220ENST00000617470 1952 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 EXOC3-AS1-202ENST00000623673 1663 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
BRINP3Q76B58 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms