Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZW49

PAXIP1, PAX-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,069 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAXIP1Q6ZW49 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 AC009014.1-201ENST00000607574 1667 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 DNAJC4-201ENST00000321460 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 TOX2-201ENST00000341197 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.43
PAXIP1Q6ZW49 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 GPR143-203ENST00000467482 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 AC016582.3-201ENST00000589653 561 ntTSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 KRTCAP3-207ENST00000543753 956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 AC007993.2-201ENST00000592842 521 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 IGHV3-30-201ENST00000603660 431 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PAXIP1Q6ZW49 RPL23AP53-202ENST00000606507 370 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.7 ms