Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZT52

FAM43B, Protein FAM43B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 329 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM43BQ6ZT52 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
FAM43BQ6ZT52 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 CCDC63-201ENST00000308208 1993 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 DPYSL5-202ENST00000401478 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 NUP160-203ENST00000526870 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 ARHGDIA-202ENST00000400721 1568 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 MIEF2-207ENST00000578621 540 ntTSL 4 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 ZMAT3-203ENST00000432729 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 RFXAP-201ENST00000255476 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 AL121906.2-201ENST00000621597 723 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 CTDSP2-204ENST00000548823 1368 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 FXYD3-203ENST00000435734 1467 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 HLA-G-202ENST00000376815 851 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 HLA-G-203ENST00000376818 1127 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FAM43BQ6ZT52 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
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