Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSB3

LINC00299, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00299, humanhuman

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00299Q6ZSB3 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 AC079328.2-202ENST00000560903 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 OPN5-204ENST00000489301 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 GNB2-206ENST00000424361 1478 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 FBXO31-201ENST00000311635 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 P2RY11-201ENST00000321826 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 AC055733.4-201ENST00000638462 1354 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 DLG3-201ENST00000194900 6112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LINC00299Q6ZSB3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LINC00299Q6ZSB3 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms