Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXY8

TMC5, Transmembrane channel-like protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 1,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC5Q6UXY8 HSD11B1L-219ENST00000581893 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 TM7SF2-202ENST00000345348 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 NCK2-201ENST00000233154 2683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 ZNF688-205ENST00000563707 244 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 HSD17B12-213ENST00000637401 866 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 CCNL1-203ENST00000461804 1998 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 AC004882.1-201ENST00000416352 590 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMC5Q6UXY8 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMC5Q6UXY8 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMC5Q6UXY8 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMC5Q6UXY8 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMC5Q6UXY8 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMC5Q6UXY8 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMC5Q6UXY8 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMC5Q6UXY8 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMC5Q6UXY8 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms