Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWD8

C16orf54, Transmembrane protein C16orf54, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C16orf54Q6UWD8 FDXR-219ENST00000583917 1762 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 MAMSTR-203ENST00000594582 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 RTCA-201ENST00000260563 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 OXER1-201ENST00000378661 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ZNF282-203ENST00000479907 1815 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 IGFLR1-201ENST00000246532 1645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 RAVER2-201ENST00000294428 4398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 OSCAR-208ENST00000611261 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 CDH5-202ENST00000539168 1672 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 TBCB-201ENST00000221855 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AGAP3-202ENST00000397238 3225 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ZGPAT-203ENST00000357119 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 GPR162-203ENST00000428545 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 CHRDL2-210ENST00000622063 1691 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 RASL12-201ENST00000220062 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 TRABD-204ENST00000395829 1628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 NIPAL4-202ENST00000435489 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 IGHV3-33-201ENST00000390615 431 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
C16orf54Q6UWD8 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms