Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q788

APOA5, Apolipoprotein A-V, humanhuman

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOA5Q6Q788 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 BHLHA15-201ENST00000314018 706 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
APOA5Q6Q788 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 BCL7A-201ENST00000261822 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 MKRN1-208ENST00000474576 1661 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 SETD6-201ENST00000219315 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
APOA5Q6Q788 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.8 ms