Protein–RNA interactions for Protein: Q58F21

BRDT, Bromodomain testis-specific protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 947 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRDTQ58F21 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 PARL-201ENST00000311101 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 THEM4-205ENST00000489410 643 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 HOXB-AS3-204ENST00000466037 522 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
BRDTQ58F21 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 CDC42SE2-206ENST00000503291 2025 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 ANAPC1P1-202ENST00000616781 1771 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 TSPAN3-210ENST00000561277 1592 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 USP25-202ENST00000285681 5216 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
BRDTQ58F21 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms