Protein–RNA interactions for Protein: Q56UQ5

TPT1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q56UQ5 TPD52L1-201ENST00000304877 1468 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 DALRD3-202ENST00000341949 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 LAG3-202ENST00000441671 1576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 SLC25A10-201ENST00000331531 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Q56UQ5 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 PHOSPHO1-202ENST00000413580 2173 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 AC007114.1-201ENST00000576871 713 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 TMCO6-203ENST00000394671 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 PRKRA-201ENST00000325748 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 BORCS8-MEF2B-202ENST00000444486 1492 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Q56UQ5 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Q56UQ5 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Q56UQ5 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q56UQ5 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q56UQ5 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q56UQ5 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q56UQ5 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q56UQ5 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q56UQ5 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q56UQ5 RPUSD1-202ENST00000561734 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 GNB4-204ENST00000468623 1360 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PTGER3-212ENST00000628037 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 TUBGCP3-204ENST00000464139 2461 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PKMYT1-213ENST00000574385 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Q56UQ5 TOLLIP-201ENST00000263646 2283 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms