Protein–RNA interactions for Protein: Q16281

CNGA3, Cyclic nucleotide-gated cation channel alpha-3, humanhuman

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Length 694 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGA3Q16281 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 STAC-204ENST00000457375 1366 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SLC25A39-212ENST00000590194 1542 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 BID-203ENST00000399765 1879 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 AP005212.1-201ENST00000581547 1997 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 GLIPR2-203ENST00000396613 1917 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 PAGR1-201ENST00000320330 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SAPCD2P1-201ENST00000395413 1184 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 SUMF2-204ENST00000395436 1683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 CLN5-201ENST00000377453 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
CNGA3Q16281 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 CLDND1-201ENST00000341181 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SLC29A4P1-201ENST00000398760 971 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 VMO1-204ENST00000441199 741 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 DBNL-220ENST00000494774 2117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 HOXA4-202ENST00000428284 1595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 DDX55-205ENST00000538744 1735 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 POLDIP2-202ENST00000618887 1524 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 TEAD2-210ENST00000601519 2167 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 ALG5-202ENST00000443765 1119 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 ARFRP1-210ENST00000614942 2554 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 PKMYT1-216ENST00000574730 1806 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 FAM129C-203ENST00000449408 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 PKM-215ENST00000565154 2004 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CNGA3Q16281 COPS7A-208ENST00000538410 1610 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
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