Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 AL161756.1-202ENST00000359491 1717 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 EEF1A2-202ENST00000298049 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 TTLL7-214ENST00000610996 2028 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
SNCBQ16143 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 GRB10-208ENST00000403097 5432 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 LBX2-203ENST00000460508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 SYTL1-211ENST00000618673 1712 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 HOXA11-AS-204ENST00000522674 1549 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 TP53BP2-202ENST00000391878 4741 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
SNCBQ16143 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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