Protein–RNA interactions for Protein: Q13796

SHROOM2, Protein Shroom2, humanhuman

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Length 1,616 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHROOM2Q13796 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.6■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 FAM170B-201ENST00000311787 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC32.59■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 TMPRSS5-202ENST00000536856 1811 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC32.59■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC32.58■■■□□ 2.81
SHROOM2Q13796 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC32.57■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 C16orf91-201ENST00000442039 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 PTENP1-AS-201ENST00000627688 873 ntTSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 AGTR1-203ENST00000404754 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 PACSIN3-201ENST00000298838 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC32.55■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC32.55■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.54■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 NPAS1-207ENST00000602189 1643 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC32.52■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC32.51■■■□□ 2.8
SHROOM2Q13796 RBBP7-202ENST00000380084 2036 ntTSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.8
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