Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

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Length 776 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 VCPKMT-202ENST00000395860 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 AC005224.2-201ENST00000571192 1885 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 MIR2861-201ENST00000636310 90 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 GABRD-213ENST00000640067 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 PRKAG2-203ENST00000418337 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 TSC22D3-205ENST00000372390 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 NSMF-203ENST00000371472 1852 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 MATK-215ENST00000619596 1740 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 MTUS2-202ENST00000380808 1793 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 AC245041.2-204ENST00000610809 1962 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 LINC00605-201ENST00000514902 1558 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
CUL1Q13616 TOR1A-201ENST00000351698 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 ARRB2-202ENST00000346341 1769 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
CUL1Q13616 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
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