Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 RNF8-204ENST00000469731 1800 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 GLT8D1-206ENST00000478968 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 HYI-206ENST00000372434 1025 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 FAIM-203ENST00000393034 927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 TMEM79-201ENST00000295694 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 SEC11A-201ENST00000268220 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ECHDC2-221ENST00000536120 1446 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 NFYC-204ENST00000372653 1862 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 DPF1-201ENST00000355526 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 SPOCK2-209ENST00000536168 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ADRA1B-201ENST00000306675 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ARSE-205ENST00000540563 1990 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 NTN4-207ENST00000553059 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 ENTPD8-201ENST00000344119 2111 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 WIPI2-203ENST00000401525 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 MGAT1-204ENST00000427865 1919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 SMCO4-201ENST00000298966 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TOP3AQ13472 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms