Protein–RNA interactions for Protein: Q13342

SP140, Nuclear body protein SP140, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SP140Q13342 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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SP140Q13342 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 AL589743.5-201ENST00000616611 1050 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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SP140Q13342 MON1A-203ENST00000455683 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 CHRNB2-205ENST00000637900 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
SP140Q13342 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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SP140Q13342 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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SP140Q13342 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
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SP140Q13342 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
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SP140Q13342 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP140Q13342 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP140Q13342 AGMAT-201ENST00000375826 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP140Q13342 CD55-203ENST00000367063 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP140Q13342 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP140Q13342 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP140Q13342 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP140Q13342 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP140Q13342 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP140Q13342 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP140Q13342 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP140Q13342 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SP140Q13342 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
SP140Q13342 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
SP140Q13342 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
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