Protein–RNA interactions for Protein: Q13285

NR5A1, Steroidogenic factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR5A1Q13285 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 B4GALNT1-208ENST00000550764 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 SLC25A46-202ENST00000447245 1575 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 HMOX1-201ENST00000216117 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 SPHK2-213ENST00000601712 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 ODC1-202ENST00000405333 1943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 ADRM1-201ENST00000253003 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 PGM5P4-201ENST00000421970 445 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 AF201337.1-201ENST00000520239 748 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 PHB2-213ENST00000546111 858 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 ACYP2-207ENST00000606082 713 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 UGDH-206ENST00000507089 1712 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 AC105020.6-201ENST00000621523 1217 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 DPP3P2-201ENST00000416030 1696 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 TACC3-213ENST00000617535 1693 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 NAPSA-201ENST00000253719 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 KLHL35-201ENST00000376292 1500 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 GLG1-214ENST00000627032 2147 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 FUZ-216ENST00000533418 1524 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 GLT1D1-204ENST00000442111 2995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 MKRN4P-201ENST00000444706 1521 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
NR5A1Q13285 PITPNB-205ENST00000455418 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NR5A1Q13285 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms