Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 MFSD7-204ENST00000503156 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 ST8SIA1-204ENST00000404299 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 CDKN2A-205ENST00000479692 544 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 ENOSF1-201ENST00000251101 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 LMAN1L-201ENST00000309664 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 HDDC3-202ENST00000394272 1880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 TAF7-201ENST00000313368 2334 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 SNX21-201ENST00000342644 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 PCDHB12-203ENST00000624949 1963 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 FOXI1-202ENST00000449804 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 AC110285.4-201ENST00000572590 424 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 SH3BGRL3-201ENST00000270792 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 CYP2A7-202ENST00000301146 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 EPS8L1-209ENST00000588359 1407 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 SLC2A8-215ENST00000610552 1763 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 RPL29-209ENST00000495383 713 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 NELFE-202ENST00000375429 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 MORF4L2-AS1-201ENST00000435306 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 TSSC4-203ENST00000380996 1544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 CHKB-201ENST00000406938 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ERCC8Q13216 PRSS33-204ENST00000576886 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms