Protein–RNA interactions for Protein: Q12980

NPRL3, GATOR complex protein NPRL3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPRL3Q12980 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 CEP55-201ENST00000371485 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 RNF224-201ENST00000445101 1798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 C17orf62-204ENST00000437807 2242 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 ATG4B-204ENST00000402096 1685 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 RUFY3-203ENST00000417478 2143 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 ZNF511-201ENST00000359035 2004 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 RASSF7-204ENST00000431809 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 SPATA22-210ENST00000573128 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 MIR5787-201ENST00000611784 55 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 LBX2-AS1-202ENST00000603175 2083 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 OGG1-205ENST00000344629 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 OTUB1-209ENST00000538426 1729 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
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NPRL3Q12980 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 CRTC1-204ENST00000601916 1834 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 TINAGL1-201ENST00000271064 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
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NPRL3Q12980 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
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NPRL3Q12980 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 MBNL3-202ENST00000370844 1643 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 PKMYT1-204ENST00000440027 2061 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 TREX2-202ENST00000334497 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 FPGS-203ENST00000373247 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 TAF5L-201ENST00000258281 3112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 COQ10A-201ENST00000308197 1652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
NPRL3Q12980 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
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