Protein–RNA interactions for Protein: Q12906

ILF3, Interleukin enhancer-binding factor 3, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ILF3Q12906 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.127e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.127e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.127e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.127e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.127e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-208ENST00000519211 620 ntTSL 315.77■□□□□ 0.127e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.097e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-206ENST00000518775 920 ntTSL 515.58■□□□□ 0.087e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SERINC2-205ENST00000536384 2062 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.087e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SERINC2-203ENST00000487207 735 ntTSL 215.57■□□□□ 0.087e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.087e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-214ENST00000580296 733 ntTSL 315.52■□□□□ 0.081e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SPG7-204ENST00000561911 1025 ntTSL 515.46■□□□□ 0.077e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SERINC2-204ENST00000491976 2807 ntTSL 215.43■□□□□ 0.067e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.057e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RBM6-219ENST00000491874 480 ntTSL 315.31■□□□□ 0.047e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 DPH7-206ENST00000472113 1414 ntTSL 515.26■□□□□ 0.037e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.027e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 DPH7-212ENST00000485189 797 ntTSL 315.16■□□□□ 0.027e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 TECR-220ENST00000600083 1204 ntTSL 2 BASIC14.99□□□□□ -0.017e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TECR-207ENST00000596073 1170 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.017e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.027e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-203ENST00000517568 692 ntTSL 414.91□□□□□ -0.027e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.057e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-202ENST00000403027 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.057e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.077e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RLF-201ENST00000372771 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.081e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.087e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RFWD3-204ENST00000572337 586 ntTSL 414.5□□□□□ -0.092e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-222ENST00000522644 1027 ntTSL 514.5□□□□□ -0.097e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RBM6-206ENST00000433811 582 ntTSL 314.5□□□□□ -0.097e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ANO6-204ENST00000426898 2780 ntTSL 214.46□□□□□ -0.097e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TECR-225ENST00000601652 551 ntTSL 414.42□□□□□ -0.17e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.117e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CATSPERE-206ENST00000464170 762 ntTSL 314.31□□□□□ -0.127e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.137e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.137e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 IQCB1-203ENST00000393650 2253 ntTSL 514.25□□□□□ -0.137e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 C10orf76-205ENST00000495001 2464 ntTSL 214.15□□□□□ -0.147e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NARF-220ENST00000582907 1454 ntTSL 514.05□□□□□ -0.161e-7■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 DPH7-204ENST00000467768 750 ntTSL 513.9□□□□□ -0.187e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.197e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 ZNF395-201ENST00000344423 4808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.227e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.227e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 CATSPERE-202ENST00000366533 3019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.247e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 SMIM14-201ENST00000295958 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.297e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 NUBPL-201ENST00000281081 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.37e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.327e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CATSPERE-203ENST00000366534 3333 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.337e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 WHRN-201ENST00000265134 2847 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.347e-6■■■■□ 19.9
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ILF3Q12906 PPARG-206ENST00000397012 2006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.357e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CATSPERE-201ENST00000366531 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.357e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 GINS1-204ENST00000484893 583 ntTSL 512.78□□□□□ -0.367e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SLC39A11-201ENST00000255559 2737 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.367e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RBM6-218ENST00000488807 675 ntTSL 512.73□□□□□ -0.377e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TECR-211ENST00000598298 868 ntTSL 512.72□□□□□ -0.377e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SLC39A11-213ENST00000582769 567 ntTSL 512.65□□□□□ -0.387e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ZNF395-209ENST00000522795 501 ntTSL 312.59□□□□□ -0.397e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 CNOT8-217ENST00000521450 1158 ntTSL 2 BASIC12.54□□□□□ -0.47e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RDH11-207ENST00000554731 888 ntTSL 312.5□□□□□ -0.417e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SMIM14-205ENST00000511809 830 ntTSL 2 BASIC12.48□□□□□ -0.417e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 KIAA1551-206ENST00000540924 362 ntTSL 212.48□□□□□ -0.417e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 IQCB1-202ENST00000349820 1919 ntTSL 1 (best) BASIC12.47□□□□□ -0.417e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 C14orf159-218ENST00000521064 544 ntTSL 412.41□□□□□ -0.427e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 RFWD3-201ENST00000361070 4957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.422e-7■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TOP3A-215ENST00000583328 727 ntTSL 212.33□□□□□ -0.447e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SPG7-211ENST00000565370 686 ntTSL 312.26□□□□□ -0.457e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 PCK2-212ENST00000560106 782 ntTSL 512.21□□□□□ -0.457e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TSPAN9-206ENST00000537971 4284 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.18□□□□□ -0.467e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ERBB2-202ENST00000406381 4564 ntTSL 5 BASIC12.17□□□□□ -0.467e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 FBXO16-210ENST00000521548 2983 ntTSL 212.16□□□□□ -0.467e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 IQCB1-204ENST00000460108 988 ntTSL 512.11□□□□□ -0.477e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TECR-205ENST00000594807 569 ntTSL 412.11□□□□□ -0.477e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 SMIM14-202ENST00000505729 612 ntTSL 412.09□□□□□ -0.477e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.487e-6■■■■□ 19.9
ILF3Q12906 TRIM35-201ENST00000305364 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.02□□□□□ -0.497e-6■■■■□ 19.9
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