Protein–RNA interactions for Protein: Q12766

HMGXB3, HMG domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,538 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB3Q12766 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 SUN1-220ENST00000457378 1309 ntTSL 1 (best) BASIC36.11■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 CRYGFP-201ENST00000418459 633 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.1■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC36.09■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC36.09■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.09■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 NPY-202ENST00000405982 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 GPR78-201ENST00000382487 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 FAM76A-205ENST00000419687 1661 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC36.08■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 FAM167A-207ENST00000534308 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
HMGXB3Q12766 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.07■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC36.07■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 ABHD11-207ENST00000458339 890 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC36.06■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC36.06■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 S1PR5-204ENST00000617721 1698 ntTSL 5 BASIC36.05■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 KDELR3-201ENST00000216014 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC36.04■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC36.04■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 SLC38A7-205ENST00000564010 1437 ntTSL 2 BASIC36.04■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC36.04■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.03■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC36.03■■■■□ 3.36
HMGXB3Q12766 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms